לחיסון פרבנר (נקרא גם חיסון פנוימוקוקים) תופעות לוואי מדווחות: כאב, נפיחות ואדמומיות באזור ההזרקה אשר נמשכים כ- 48 שעות. בחולי HIV נרשמה עליה ברמות הנגיף בדם החולים בעקבות החיסון. תופעות לוואי נוספות הן כאבי ראש, הקאות, בחילות, חולשה ועייפות וכאבי שרירים, כאב בחזה, כשל לבבי, הזעות, תחושת כבדות, דלקת מפרקים, תסמונת גיאן ברה, פריחה, עליה ברמות מדדי הדלקת בדם שבץ מוחי ומוות. חלק מתופעות אלו הנן חריפות (תופעות הכוללות צליעה על הרגל המחוסנת). תגובות מקומיות קורות לרוב במנה הרביעית. תופעות נוספות נפוצות הן חום, חוסר תאבון, אי שקט, ברונכיוליטיס, דלקת קיבה ומעיים, דלקת ריאות, אסתמה, עצירות נשימה, קוליטיס, ספסיס ועוד.